第三十條鼓勵兩岸科研機構、高等院校、企業(yè)共同設立兩岸合作研發(fā)機構，聯(lián)合建設重點實驗室，開展基礎研究、前沿技術和共性關鍵技術研究，聯(lián)手培養(yǎng)研發(fā)團隊和技術人才。
第三十一條在臺灣地區(qū)取得職業(yè)資格的專業(yè)人員申請到自貿(mào)試驗區(qū)內(nèi)從業(yè)，符合國家規(guī)定的，簡化相應程序，允許其在自貿(mào)試驗區(qū)內(nèi)執(zhí)業(yè)。具體辦法由市人民政府制定。
第三十二條探索兩岸青年交流合作新模式、新機制、新領域。鼓勵和支持臺灣地區(qū)青年來廈創(chuàng)業(yè)就業(yè)。在自貿(mào)試驗區(qū)設立兩岸青年創(chuàng)業(yè)基地，在創(chuàng)業(yè)場所、創(chuàng)業(yè)啟動資金、社會保障等方面給予扶持，定期組織兩岸青年進行創(chuàng)業(yè)交流。
第三十三條自貿(mào)試驗區(qū)探索與金門在貨物貿(mào)易、投資、人員往來的便利，推動在金門建設兩岸貨物集散轉運中心，促進廈金在觀光旅游、健康照護、跨境電子商務、職業(yè)技術教育及培訓、金融服務等產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。
第三十四條支持兩岸海關、檢驗檢疫開展合作交流，實現(xiàn)兩岸快速通關和執(zhí)法合作，探索在自貿(mào)試驗區(qū)內(nèi)對進口臺灣地區(qū)商品實施第三方檢驗結果采信制度，符合采信要求的，試行快速驗放。
第三十五條自貿(mào)試驗區(qū)推動對臺船舶登記制度創(chuàng)新。推動符合條件的臺資企業(yè)所有的船舶在自貿(mào)試驗區(qū)內(nèi)落戶登記。
第六章 促進產(chǎn)業(yè)升級和“一帶一路”建設
第三十六條鼓勵自貿(mào)試驗區(qū)發(fā)展高端產(chǎn)業(yè)、特色產(chǎn)業(yè)，促進先進制造業(yè)、服務業(yè)等高端產(chǎn)業(yè)集聚發(fā)展，在航空維修、電子信息、軟件、新材料、生物醫(yī)藥、海洋裝備等領域，建設具有較強自主創(chuàng)新能力和國際競爭力的特色產(chǎn)業(yè)集群，推進建設國家自主創(chuàng)新示范區(qū)。
第三十七條制定航空維修產(chǎn)業(yè)發(fā)展具體扶持政策，支持自貿(mào)試驗區(qū)內(nèi)航空維修業(yè)發(fā)展，創(chuàng)新航空維修監(jiān)管模式。完善航空維修配套產(chǎn)業(yè)鏈，引進和培養(yǎng)航空維修領域?qū)I(yè)人才，發(fā)展航空領域?qū)I(yè)院校。
第三十八條自貿(mào)試驗區(qū)支持國際貿(mào)易、倉儲物流、加工制造等傳統(tǒng)業(yè)態(tài)轉型升級和服務貿(mào)易發(fā)展。推動離岸貿(mào)易、國際大宗商品交易、期貨保稅交割、跨境電子商務、服務外包業(yè)務、出境加工等新型貿(mào)易發(fā)展。
提供跨國公司在區(qū)內(nèi)設立總部的便利化機制，建立整合貿(mào)易、物流、結算等功能的營運中心。
建設文化藝術保稅交易平臺，推動設立文化產(chǎn)業(yè)引導基金。
第三十九條自貿(mào)試驗區(qū)建設集金融、保險、租賃、信息咨詢、航運人才培養(yǎng)等多種服務功能于一體的航運物流服務體系。設立航運物流產(chǎn)業(yè)引導基金。推進廈門—東盟、中東主要港口城市合作網(wǎng)絡和機制建設，完善郵輪母港建設，支持保稅港區(qū)兼營內(nèi)貿(mào)業(yè)務。
第四十條自貿(mào)試驗區(qū)鼓勵發(fā)展航運金融、國際船舶運輸、國際航運經(jīng)紀、國際船舶代理、國際船舶管理、船舶交易、國際船員服務和國際郵輪旅游等國際航運現(xiàn)代服務業(yè)。允許在自貿(mào)試驗區(qū)內(nèi)注冊的大陸資本郵輪企業(yè)所屬的方便旗郵輪，經(jīng)批準從事兩岸四地郵輪運輸。
鼓勵自貿(mào)試驗區(qū)開展海運快件國際和臺港澳中轉集拼業(yè)務。
第四十一條 自貿(mào)試驗區(qū)鼓勵對臺海運快件業(yè)務發(fā)展，支持中歐、中亞等國際班列運營，推動建設連接臺灣與中亞、歐洲區(qū)域轉運中心和陸海樞紐城市，融入“一帶一路”建設。
第四十二條 自貿(mào)試驗區(qū)應當作為“一帶一路”國家戰(zhàn)略推動市場主體走向國際發(fā)展的先行區(qū)，鼓勵自貿(mào)試驗區(qū)內(nèi)企業(yè)開展多種形式的對外投資，鼓勵與“一帶一路”沿線國家和 地區(qū)開展基礎設施、貿(mào)易投資、海洋經(jīng)濟、旅游會展、人文交流等領域的交流合作，制定支持企業(yè)投資“一帶一路”沿線國家和地區(qū)的具體政策。
第四十三條自貿(mào)試驗區(qū)鼓勵金融機構提升跨境金融服務水平，探索在自貿(mào)試驗區(qū)內(nèi)開展人民幣跨境再保險業(yè)務，以臺灣為重點，向東盟與“一帶一路”沿線國家或者地區(qū)輻射。
第四十四條加強與“一帶一路”沿線國家自貿(mào)園區(qū)合作，完善國際執(zhí)法互助，加強與“一帶一路”沿線國家口岸執(zhí)法機構的機制化合作。
