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1741個(gè)!迄今最大的小鼠全腦神經(jīng)元數(shù)據(jù)集建成

m.dddjmc.com 來(lái)源: 科技日?qǐng)?bào)數(shù)字報(bào) 用手持設(shè)備訪(fǎng)問(wèn)
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  腦,是我們每個(gè)人的“頂級(jí)配置”。我們之所以有喜怒哀樂(lè),能夠?qū)W習(xí)、記憶、運(yùn)動(dòng),擁有良好的睡眠,都離不開(kāi)大腦的調(diào)控。神經(jīng)元是大腦行使功能的基本單位,它的3D結(jié)構(gòu)特征可以揭示腦內(nèi)神經(jīng)信號(hào)的流動(dòng),反映大腦的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)連接,也是鑒定神經(jīng)元類(lèi)別的重要參數(shù)。

  不過(guò),想清晰地看清并重建大量神經(jīng)元全腦形態(tài),還存在諸多瓶頸。10月13日,科技日?qǐng)?bào)記者從東南大學(xué)獲悉,該校聯(lián)合美國(guó)艾倫腦科學(xué)研究所、華中科技大學(xué)、溫州醫(yī)科大學(xué)、騰訊等機(jī)構(gòu),生成了目前世界上數(shù)目最大的關(guān)于小鼠的1741個(gè)單細(xì)胞神經(jīng)元的數(shù)據(jù)集,并鑒定了來(lái)自皮層、屏狀核、丘腦和紋狀體等腦區(qū)的11種主要神經(jīng)元投射類(lèi)型,成果近日發(fā)表于國(guó)際期刊《自然》。

  “雖然小鼠的大腦和人類(lèi)大腦存在差異,但是在結(jié)構(gòu)和細(xì)胞類(lèi)型方面大體上是相似的,因此鼠腦神經(jīng)元的研究為解析人腦的神經(jīng)元類(lèi)別以及探索神經(jīng)系統(tǒng)疾病如精神分裂癥、自閉癥、抑郁癥等的機(jī)制提供了重要信息。”論文共同第一作者、東南大學(xué)腦科學(xué)與智能技術(shù)研究院副研究員劉力娟告訴科技日?qǐng)?bào)記者。

  諸多瓶頸曾制約全腦神經(jīng)元網(wǎng)絡(luò)重建

  走進(jìn)東南大學(xué)腦科學(xué)與智能技術(shù)研究院(以下簡(jiǎn)稱(chēng)東大腦智院),工作人員正在電腦前標(biāo)注鼠腦的神經(jīng)元結(jié)構(gòu)信息。屏幕上的大腦輪廓中,盡管做了神經(jīng)元的選擇性標(biāo)記,神經(jīng)元的結(jié)構(gòu)仍然密密麻麻,像一堆線(xiàn)團(tuán)。

  人腦約有860億個(gè)神經(jīng)元,神經(jīng)元間的有序連接網(wǎng)絡(luò)決定了大腦能實(shí)現(xiàn)哪些功能。了解神經(jīng)元結(jié)構(gòu),使連接路徑可視化,將有助于闡明神經(jīng)元的功能。

  小鼠是研究腦科學(xué)的重要模式動(dòng)物,它們有學(xué)習(xí)、記憶和社交能力,其大腦擁有上億個(gè)神經(jīng)元,觀(guān)察小鼠的神經(jīng)元結(jié)構(gòu),對(duì)于了解人腦結(jié)構(gòu)和功能有重要參考價(jià)值。

  不過(guò),長(zhǎng)期以來(lái),重建高通量的全腦神經(jīng)元網(wǎng)絡(luò)一直存在瓶頸。

  “小鼠的腦只有約成人指甲蓋大小,而且有蛋白質(zhì)等結(jié)構(gòu),不透明,所以普通的光學(xué)顯微成像技術(shù)很難獲得全腦圖像,這也是全腦研究的難點(diǎn)。”劉力娟說(shuō),此次研究中,科研團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了選擇性標(biāo)記的小鼠品系樣本,中國(guó)科學(xué)院院士駱清銘教授以及華中科技大學(xué)龔輝教授團(tuán)隊(duì)完成了基于熒光顯微光學(xué)切片斷層成像系統(tǒng)的高分辨率小鼠全腦圖像采集。

  但高分辨率也令小鼠全腦圖像體量巨大,達(dá)到15—20TB,這對(duì)圖像平臺(tái)的算法和數(shù)據(jù)處理能力形成很大挑戰(zhàn)。

  “有的神經(jīng)元信號(hào)很弱,看清楚很難,而且神經(jīng)元分枝復(fù)雜,一旦追蹤錯(cuò)了,就無(wú)法準(zhǔn)確還原神經(jīng)元形態(tài),也就是就追錯(cuò)了神經(jīng)元發(fā)送信號(hào)的路徑。”劉力娟所言非虛,全腦神經(jīng)元結(jié)構(gòu)龐大,某些小鼠的腦皮層細(xì)胞可以跨越兩個(gè)腦半球,且分枝繁多,總長(zhǎng)度可達(dá)40厘米左右,因此準(zhǔn)確快速地重建神經(jīng)元十分困難。

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