在確立了合作抗日的統(tǒng)一戰(zhàn)線后，對(duì)如何具體落實(shí)紅軍入晉抗日問(wèn)題，雙方又進(jìn)行了多次洽談。對(duì)于紅軍改編為八路軍向山西開(kāi)進(jìn)，建立抗日根據(jù)地的建議，閻錫山表示贊成。他要彭雪楓轉(zhuǎn)告毛澤東，請(qǐng)求紅軍會(huì)合晉軍一個(gè)集團(tuán)軍，在五臺(tái)山周圍建立根據(jù)地。

　　1937年10月下旬，閻錫山向毛澤東等提出“在不利情況下，兩軍團(tuán)結(jié)一致，用游擊戰(zhàn)爭(zhēng)堅(jiān)決抵抗日寇進(jìn)攻之方針”。毛澤東通過(guò)彭雪楓作了答復(fù)，并向閻錫山詳細(xì)提出了開(kāi)展游擊戰(zhàn)爭(zhēng)的戰(zhàn)略原則和具體部署。閻錫山表示贊同毛澤東的建議，同意八路軍分別以五臺(tái)山、管涔山、太行山、呂梁山等為依托，開(kāi)展廣泛的敵后游擊戰(zhàn)爭(zhēng)。

　　1938年1月，閻錫山參加蔣介石召集的軍事會(huì)議。到漢口，他囑告山西駐漢口辦事處負(fù)責(zé)人等幾個(gè)親信，籌劃在漢口辦一日?qǐng)?bào)或雜志，用以宣傳抗日戰(zhàn)爭(zhēng)，壯大自己的力量，擴(kuò)大影響。4月1日，《自由中國(guó)》雜志問(wèn)世。在延安的毛澤東應(yīng)約為該刊題詞：“一切愛(ài)國(guó)人民團(tuán)結(jié)起來(lái)，為自由的中國(guó)而斗爭(zhēng)。”

　　臨汾失守后，閻錫山對(duì)抗戰(zhàn)逐漸喪失信心。

　　1939年12月，閻錫山挑起了反共的“晉西事變”，毛澤東等一直采取了克制態(tài)度，多次指示“不公開(kāi)刺激閻錫山”。事變發(fā)生后，1939年12月20日，毛澤東指示彭德懷前往秋林，當(dāng)面向閻錫山講明利害關(guān)系，做調(diào)解工作。

　　1940年2月23日，毛澤東起草致國(guó)民黨第二戰(zhàn)區(qū)司令長(zhǎng)官閻錫山的信，表示愿意和平解決山西發(fā)生的磨擦事件，并告知派肖勁光和王若飛前往談判。離開(kāi)延安時(shí)，毛澤東把信交給肖勁光，并對(duì)肖勁光和王若飛說(shuō)：

　　“你們?nèi)ソo閻錫山講清楚，我們共產(chǎn)黨是誠(chéng)心實(shí)意要同國(guó)民黨合作抗日嘛，你們?yōu)槭裁匆也俑?，制造摩擦，殺人掠地。讓日本?qiáng)盜高興呢 ?抗戰(zhàn)初期，閻錫山同我們合作得還可以嘛，為什么現(xiàn)在又跟著蔣介石的指揮棒轉(zhuǎn)，同我們過(guò)不去呢 ?我們也不是好惹的，請(qǐng)他不要敬酒不吃吃罰酒 !”