新型冠狀病毒的起源和演變一直備受關注。有關新冠病毒是否來自華南海鮮市場,經(jīng)由這里非法交易的野生動物再傳播到人,以及該市場是否是疫情起源地等問題,一直存在爭議。
3月3日,中國科學院主辦的《國家科學評論》(National Science Review)發(fā)表題為《關于SARS-CoV-2的起源和持續(xù)進化》的論文,通過對迄今最大規(guī)模的新冠病毒全基因組分子進化分析,揭示了新冠病毒已經(jīng)演化出L和S兩個亞型,這兩個亞型在地域分布以及人群中的比例相距甚遠。而且根據(jù)新型冠狀病毒的演變方式,作者推測這兩種亞型的傳播能力、致病嚴重程度或許存在較大區(qū)別。
L型病毒傳播能力強 致病性高
北京大學生命科學學院生物信息中心陸劍研究員與中國科學院上海巴斯德研究所崔杰研究員是這篇論文的共同通訊作者。作者表示:“如果這一結論得到證實,將有可能指導我們更好地對新冠肺炎進行差異化的治療和防控。”
研究分析的103個新冠病毒基因組數(shù)據(jù)全部來源于公共數(shù)據(jù)庫。這些病毒樣本的基因序列的收集時期最早是去年12月24日,最晚是今年2月5日。分析表明,這些病毒株一共存在149個突變位點,且多數(shù)突變在近期發(fā)生。
在這103個病毒株中,有101個屬于兩個亞型之一。具體而言,兩個亞型的區(qū)別在于病毒RNA基因組的第28144位點,L型是T堿基(對應亮氨酸,Leu),S型是C堿基(對應絲氨酸,Ser)。通過與其他冠狀病毒比較,作者發(fā)現(xiàn)S型新冠病毒與蝙蝠來源的冠狀病毒在進化樹上更接近,從而得出S型相對更古老的結論。
但研究人員意外發(fā)現(xiàn),相對古老的S型新冠病毒并沒有因為在人群中傳播的時間更長,而感染更多的人。基因組數(shù)據(jù)表明,感染S型的比例占30%,反倒是相對年輕的L型新冠病毒的感染比例占70%,而且每個L型病毒株比S型攜帶了相對更多的新生突變。
基于上述反常現(xiàn)象,作者推測:“L型病毒傳播能力更強,或者在人體內(nèi)復制更快,因此可能意味著其毒力也更大。”
作者還專門比較了1月7日前后S型和L型所占比例的變化,他們發(fā)現(xiàn)L型在病毒株中的比例下降,S型比例上升。作者由此推測:“這可能是因為L型病毒的患者更容易表現(xiàn)出癥狀,因而更容易受到人工干預,從而使L型新冠病毒受到的負選擇壓力更大,感染的人數(shù)由此變少。”

