2004年臺(tái)灣地區(qū)領(lǐng)導(dǎo)人“大選”，陳水扁在臺(tái)南競選期間發(fā)生319槍擊案，詹啟賢因擔(dān)任陳水扁主治醫(yī)師，遭國民黨炮轟詹啟賢幫助陳水扁制造假傷口，卷入政治爭議。對(duì)此，詹啟賢之前在1月27日曾表示，如果被煽動(dòng)，令人遺憾，他表示，所有黨員幾乎已遺忘，如果要提沒關(guān)系，他當(dāng)時(shí)身為奇美醫(yī)院院長，從醫(yī)療專業(yè)做該做的事，沒政治考量，假設(shè)有曖昧或不正當(dāng)，這么多年應(yīng)已被揭露。
在16日與居民座談時(shí)，詹啟賢還談及年金改革。他認(rèn)為：責(zé)任在蔡當(dāng)局，不在軍公教，“因?yàn)榻?jīng)濟(jì)沒有搞好，蔡當(dāng)局缺錢，蔡當(dāng)局把責(zé)任歸給軍公教不對(duì)，污名化更是不對(duì)”。
詹指出，如今國民黨的問題在于民眾對(duì)國民黨的觀感，怎樣重新獲得社會(huì)肯定、認(rèn)同，跟民意再接近一點(diǎn)，是國民黨目前最重要、要改變的地方。詹還表示，國民黨黨部有些舊思維需要改變，“黨部都是幾十年前的照片”，年輕人不會(huì)有興趣。國民黨在臺(tái)灣有很多建設(shè)，應(yīng)該多講一點(diǎn)現(xiàn)在的事。
