連戰(zhàn)（圖片來源于網(wǎng)絡(luò)）
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公元2000年，國民黨因內(nèi)部分裂而在臺灣地區(qū)領(lǐng)導(dǎo)人選舉中慘遭失敗，首次丟掉在臺執(zhí)政權(quán)。在一片指責(zé)和質(zhì)疑聲中，李登輝辭去黨主席一職。連戰(zhàn)臨危受命，代理主席職務(wù)并在2001年國民黨首度黨主席直選中高票當(dāng)選。
此時的國民黨可謂“屋漏偏逢連夜雨”，一方面剛剛喪失執(zhí)政權(quán)，一方面宋楚瑜組建親民黨剝離了國民黨一部分基本盤，加上李登輝早前推行“去中國化”嚴(yán)重侵蝕國民黨的民意根基，導(dǎo)致實力大減。
就兩岸關(guān)系而言，民進(jìn)黨2000年5月上臺后，不斷鼓噪“臺灣正名”，否定“九二共識”，拋出兩岸“一邊一國”的分裂主張，撕裂臺灣社會，煽動仇視大陸，不斷將兩岸關(guān)系推向危險邊緣。
這一時期的國民黨，與親民黨、新黨組成泛藍(lán)聯(lián)盟，形成在立法機(jī)構(gòu)的多數(shù)政團(tuán)，對執(zhí)政的民進(jìn)黨進(jìn)行有效制衡，成為穩(wěn)定臺灣政局和兩岸關(guān)系的重要力量。
