對于這次這個事，臺大方面也給出了回應。臺大副教務長張耀文說，每個有意義的排名系統(tǒng)都有其參考價值，無可否認其結果，尤其當大部分的排名系統(tǒng)都顯示出北京大學和清華超越臺灣的各大學同一個趨勢時，那我們一定要深刻自我檢討，不能當鴕鳥視若無睹。
臺大代理校長郭大維說得更嚴重一些，他表示，“臺灣高等教育的問題相當急迫，已經(jīng)是強弩之末。”臺灣所有頂尖大學已經(jīng)面臨崩解，而他們的崩解，將對若干年后的臺灣，造成全面性沖擊，臺灣社會與產(chǎn)業(yè)將比現(xiàn)在更加缺乏競爭力。
這兩個說法撩叔都給個高分，實事求是的態(tài)度值得鼓勵，不過后面還有不少內(nèi)容。臺大副教務長接著巴拉巴拉說了一些例子和推導，最后得出的結論是，其實總名次退步，最主要是很多國家和地區(qū)在近年對高等教育的大幅投資造成的反差。他對比大陸高校和臺大的經(jīng)費，表示大陸高校經(jīng)費每年都以約20%至30%的速度成長，而臺大可能要面臨未來的負成長。
臺大代理校長的分析也大同小異，他說，退步原因主要來自于教授薪資過低，求才與留才都不易，幾所頂大的高教經(jīng)費嚴重不足，而目前島外同級大學的教授薪資是島內(nèi)數(shù)倍。更雪上加霜的是臺大教授在退休新制下，所領到的每月退休金可能比中小學教師還略低。
